07飞行时间质谱(MALDI-TOF)用于细菌鉴定

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飞行时间质谱(MALDI-TOF)用于细菌鉴定

飞行时间质谱仪器主要由两部分组成:基质辅助激光解吸电离离子源(MALDI)和飞行时间质量分析器(TOF)。MALDI的原理是用激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜,基质从激光中吸收能量传递给生物分子,而电离过程中将质子转移到生物分子或从生物分子得到质子,而使生物分子电离的过程。因此它是一种软电离技术,适用于混合物及生物大分子的测定。TOF的原理是离子在电场作用下加速飞过飞行管道,根据到达检测器的飞行时间不同而被检测即测定离子的质荷比(M/Z)与离子的飞行时间成正比,检测离子。

飞行时间质谱用于细菌鉴定

近年来,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI TOF MS)已成为常规鉴定细菌和真菌的重要工具。这是一种快速且经济高效的方法,非常适合高通量应用,例如临床实验室中的病原体识别,食品行业的质量控制或培养物收集中的生物材料验证。

MALDI-TOF for identification

BioNumericsMALDI谱图分析

BioNumerics软件在导入和处理谱图数据方面提供了很大的灵活性。 支持来自不同硬件制造商(例如Bruker,Shimadzu,VITEK MS)的数据格式,并且可以将其导入同一数据库中。该软件使用预定义或自定义的处理模板处理谱图数据。这些模板可轻松适应任何情况,并存储以备将来使用。 汇总谱图概念允许用户可以根据适合他们的质量标准将多种技术或生物拷贝数据汇总到单个谱图中。

MALDI TOF谱图(汇总谱图或单谱图)可以在``比较''窗口中用例如基于相似度的聚类分析,主成分分析(PCA)或多维标度(MDS)。峰匹配可以滤除常见的背景峰并关注于一组可区分的峰,从而大大提高了分析的灵敏度。矩阵挖掘工具对于识别潜在的生物标记非常有用。

PCA on MALDI-TOF spectra

构建自己的鉴定用质谱数据库

用于MALDI-TOF细菌鉴定的市售参考数据库通常仅针对临床相关物种,并且附带有限的一组内置鉴定方法。利用BioNumerics软件,用户可以根据所选生物的质谱图建立自己的数据库,并将这些参考集存储为识别项目。然后可以基于完整谱图或自定义峰类别并使用复杂的分类器(例如Support Vector Machines和Naive Bayesian classifiers)进行未知分离物的鉴定。


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