13抗生素耐药性分析

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抗生素耐药性分析

可以使用多种方法测试细菌分离株的抗生素抗性。 抗菌药性表示为通过系列稀释或Etest测定的最小抑菌浓度(MIC),或通过圆盘扩散法测定时的抑菌圈直径。使用BioNumerics中的抗生素敏感插件,可以设置临界值,并将抗生素抗性数据自动转换为SIR类别(敏感,中间,耐药),然后可用于计算树状图并对其进行统计分析。

Antimicrobial susceptibility testing

BioNumerics中的抗菌素敏感性分析

添加折点

        为了将抑菌圈直径或MIC值转换为SIR类,需要为所研究的生物定义临界值。 这些点由临床和实验室标准协会(CLSI)针对临床相关生物发布。 但是,对于非临床分离株,可能会出现CLSI指南不可用,并且被迫使用相关物种的点的情况。 要评估不同的临界值,或者在修改CLSI点的情况下,插件可以轻松地重新解析原始区域直径或MIC值。

导入抑菌圈直径或MIC

Experiment card with MIC values and S-I-R mapping

        可以从文本文件、Excel表格或任何与ODBC兼容的数据源(例如微软Access,微软SQL Server,Oracle,MySQL等)轻松将大量分离的抗生素耐药数据导入数据库。 在导入过程中,使用决策网络将数据自动转换为SIR类别。 每个分离的数据均显示在实验卡中,左侧为值,右侧为对应的映射。

聚类分析和统计

通常根据分离株的耐药类别使用分类系数对分离株进行聚类,将不同的值视为不同的状态。对比窗口中的颜色对应于每种抗生素类别(敏感,中或耐药)的颜色。 MIC值显示在中央面板中。 聚类可用于创建假设检验的工作组。 还可以基于数据库中的信息字段(隔离时间,地理位置,患者类型,医院等)来创建组。

Dendrogram calculated on antibiotic resistance values

BioNumerics中相关图表和统计工具的可用性,以及对数据和相关性的正确可视化,有助于趋势检测和预测细菌耐药性的未来发展。








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