5全基因组图谱分析数据模块

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全基因组图谱分析数据模块(Whole genome map data module)

全基因组图谱分析可以产生200-500个限制性酶切片段,且此技术不依赖于PCR以及序列信息,因此相较于PFGE产生的20个左右的条带可以提供细菌基因组结构上变化的信息,所以其可以识别同一爆发中相近亲缘关系非常近的菌株。

BioNumerics中的全基因组图谱分析模块提供了大量可配置的可视化选项可使用户快速定位插入缺失以及重复片段,且可以进行自定义标签设置。

同时BioNumerics内置的聚类分析算法可快速分辨出亲缘关系相近的分离株;通过内置的比对算法可以着重显示反转、缺失等突变信息,配合BioNumerics内置的分析工具用户可以进行PCA、矩阵数据挖掘等分析。另外,BioNumerics内置的多态性分析工具可快速的找出一组分离株内的特异性片段。


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