9基因组分析工具模块

9基因组分析工具模块（Genome Analysis Tools module）

基因组分析工具模块提供基因组和染色体比对分析、基因注释、wgMLST、wgSNP分析等功能。

多位点序列分型（Multilocus sequence typing，MLST）是一种基于序列的微生物分子分型手段，其技术原理是通过测定7个管家基因的序列，并根据每个位点序列的不同为其分配等位基因号，七个管家基因的等位基因号共同组成了细菌的序列型（Sequence Type，ST）。传统的基于7个管家基因序列的多位点序列分型在过去的15年中已经证明其在细菌分型领域中不可或缺的作用，但是由于其分析的等位基因个数少而导致的分辨率不高的问题也一直存在。（文章由金云台提供）

随着二代测序技术的发展及其测序成本的降低，传统的MLST技术正在逐步向wgMLST转变。由于wgMLST包含更多的基因位点（1500-2000），因此相较于传统的基于7个基因位点的MLST分型手段有着更高的精度及分辨率。

随着等位基因位点的增多势必会导致数据分析量的增大。为了解决以上的问题，BioNumerics向广大用户提供了经过全新设计开发的可以自动分配等位基因号、自动命名序列型等功能的wgMLST分析管理插件。同时BioNumerics为用户提供强大的计算引擎，用户可根据实际需求进行基于序列拼接和基于原始测序数据读长的等位基因检索。此外基于wgMLST的分析框架，用户也可以自定义二级分析框架（如cMLST、rMLST等），同时用户还可以从wgMLST分析中获取基于7个管家基因的传统的MLST分析bionumerics软件果。全自动化的分析流程以及可自定义的分析框架可大大提高实验数据分析的准确度以及实验人员的工作效率。

由于wgMLST分析流程是基于全基因组数据，配合BioNumerics的表型分析插件，用户还同时可以获取分离菌的血清型、病毒性和耐药性等数据。