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BioNumerics软件疾控3模板版

BioNumerics 7.6中文版介绍

BioNumerics是全球唯一集电泳数据、色谱数据、光谱数据、表型特征数据、基因芯片、基因组序列、氨基酸序列等多种生物信息数据格式存储和处理分析的软件平台,包括数据存储、数据分析和数据分享三大功能。优化整合不同基因组与表型来源的数据,方便用户进行数据分析管理并进行回归分析。引进业界领先的数据库引擎Oracle® 和 Microsoft® SQL Server™,为大数据管理分析提供了前提。同基因组与表型来源的数据,方便用户进行数据分析管理并进行回归分析。

随着数据分析技术的飞速发展,越来越多的行业加入到数据分析的大军里,其中高校实验室、疾控、医院、卫生等相关行业围绕数据分析及存储领域,着重致力于PFGE、wgMLST二代测序、MLST等数据分析实验,越来越多的实验室逐步引入BioNumerics中文版软件。

一、指纹模块(Fingerprint type module)

支持任意格式的光密度数据如凝胶电泳、毛细管电泳、气象色谱、液相色谱、光密度曲线、MALDI、SELDI的分析处理。同时BN提供了一系列基于电泳功能的分析插件,方便用户对可变数目串联重复序列(VNTR)、 多位点串联重复序列分析(MLVA)、 基于CECE的异源双链分析(HAD)、金黄色葡萄球菌A蛋白分型(spa-typing)、AFLP标记辅助育种(AFLP-based breeding)等实验进行数据存储与分析。

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二、特征数据模块(Character Data module)

用户可以自定义各种类型(二进制或连续型)的特征数据,包括生化以及形态学特征数据、酶动力学测试数据、抗生素抗性分析、脂肪酸甲酯以及基因芯片中的各个基因表达量数据等。根据实验情况用户可以从一到成千上万个特征数据的自定义且特征数据容量的大小不受限制。同时特征数据模块也被用来存储其它实验分析过程中的数据结果,例如在MLVA分析中存储可变数目串联重复序列的个数;MLST中的等位基因数目;抗生素抗性以及HIV抗药性分析中的抗性数据等。

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、树状分析和网络推理模块(Tree and Network Inference module)

聚类分析不同于鉴定识别,是一种非监督式学习分析,同时也是生物信息学分析中不可替代的一种分析工具。BioNumerics通过把关系数据库中的各种记录之间,各种实验之间,用多种有效的聚类算法实现多种聚类分析。