强大的数据库基础,集成网络以及广泛的分析和决策工具,包括数据挖掘,查询,聚类,识别,统计等等。
BIONUMERICS 8.0 的独特功能在于它能够将来自各种基因组和表型来源的信息组合到一个全球数据库中,并进行结论性分析。
选择满足您要求的 应用程序配置
选择:符合您要求的Bionumerics
SUITE提供GEL,MALDI和SEQ的所有功能,可根据您的不同应用需求选择四种简单的配置。
每种配置都有一个可选的COMPLIANT软件包,该软件包使整个BIONUMERICS 8平台均可按照最严格的良好生产规范(GMP)进行使用,例如FDA 21 CFR Part 11。
Bionmuerics GEL
经典指纹识别的黄金标准。
-
导入并归一化所有类型的基于凝胶和测序仪的电泳图谱 (PFGE,RAPD,rep-PCR,MLVA,MIRU-VNTR,DGGE等)
-
自动选择泳道,谱带和峰,最多选择20000个条目
-
可调背景减法,曲线平滑和斑点去除
-
多态性分析
-
搜索选定模式组之间的区分性带/峰
Bionmuerics MALDI
开启MALDI-TOF仪器的电源,以进行细菌研究。
-
元数据和从MALDI TOF仪器的原始频谱数据(像的进口生物梅里埃VITEK ® MS,RUO)
-
预定义或自定义处理模板以清除原始光谱数据
-
预定义或自定义模板以创建摘要光谱
-
创建峰表并进行统计分析
-
通过统计分析,线性判别分析(LDA),热图,…鉴定生物标志物
-
探索各种排序,分区和组验证技术
-
创建功能强大的图表和绘图。
-
通过大量统计检验验证您的假设
-
具有聚类分析,主成分分析(PCA),多维缩放(MDS)等的相似光谱的区分组
-
使用支持向量机和朴素贝叶斯分类器等机器学习算法创建和验证参考数据库,并根据该参考数据库识别未知样本
使用“抗生素敏感性”插件,可以设置截止值,以自动将抗生素抗性数据转换为SIR类别(“易感”,“中级”,“抗药性”),然后将其用于计算树状图并进行统计分析。
Bionmuerics SEQ
基于微生物WGS的类型分析的最全面的分析工具集。
-
wgMLST,wgSNP输入归功于 42种可用方案
-
在一个数据库中将WGS数据与传统技术结合起来
-
从任何NGS仪器导入测序数据以及Sanger测序数据(MLST,MLVA)
-
长读和短读混合程序集
-
在您自己的计算机或计算引擎上运行集成管道
-
细菌基因组注释
-
抵抗力和毒力基因的预测,以及其他分类方法(水疗,血清分型等)
-
引物设计,限制酶分析,ORF测定……
Bionmuerics SUITE
唯一提供以下方面的集成分析的软件平台,微生物生物信息学中的所有主要应用。
BN套件配置在一个功能强大的数据库平台中包含上述所有功能,轻松跟踪菌株的所有实验数据。它具有数据库工具以方便,生物数据管理,数据库筛选,用户管理和决策工具。
-
一维电泳胶(PFGE)
-
色谱和光谱图(MALDI-TOF)
-
WGS和Sanger序列
-
表型字符
-
通过网络共享数据库,或使用数据交换工具与协作者进行外部共享
-
网上帮助
Bionumerics8.0
是一个通用平台
进行存储和分析您的生物数据